菠萝蛋白酶为白色呈浅棕黄色无定形粉末。溶于水，不溶于乙醇；氯仿和乙醚。分子量约33000。

菠萝蛋白酶（简称菠萝酶）是从菠萝水果皮、芯等部分经生物技术制得的一种植物蛋白酶，其分子量为33000，等电点为9.55。主要含有蛋白质水解酶等多种成份。活力规格以GDU/g表示，活力规格可达3000GDU/g。富有菠萝香气浅黄棕色粉末，菠萝蛋白酶属于疏基蛋白酶，其活性中心为疏基（—SH）能进行蛋白质水解等各种生化反应，它可广泛应用于食品、医药及生物等行业。